沼液中除含有大中微量元素外，还含有17种氨基酸、腐植酸、赤霉素、吲哚乙酸、玉米素等生物活性物质，以及挥发性有机成分和有毒重金属。不同地区、不同原料、不同厌氧发酵工艺生产的沼液营养元素含量差异很大。

    沼液中也含有丰富的微生物，沼液中微生物的种类差异很大。

    沼液肥对土壤肥力的影响。发酵原料在厌氧发酵过程中流失的主要元素是碳、氮、硫等，大部分矿质养分会残留在沼渣和沼液中。

    合理施用沼液肥可有效改善土壤环境，提高土壤肥力。

    沼液肥施用对土壤生态安全的影响，沼液中含有一些重金属元素，使用沼液也可能造成土壤或植物受到污染。所需要经过沼液肥设备加工以后才能使用。

    沼液合理利用则是优良的肥料资源，利用不当则造成生态环境污染。沼液的处理方式可以归纳为直接还田消纳、自然生态净化技术、生化处理技术、高附加值开发处理技术等几种。目前，在生产中仍是以还田消纳和自然净化为主，自然净化周期较长，需要配套场地，而还田消纳和沼液配肥利用可以合理利用资源，节约化肥、改善土壤生态环境。目前，沼液的肥料化利用还存在着以下几个方面的问题，需进一步深入研究与优化。

    第一，沼液利用的生态环境风险的问题。首先，需要明确沼液对“土壤—植物”生态系统的影响。不同区域环境、不同作物、不同类型土壤对沼液的重金属和盐分的代谢不同，因此，需要通过长期的定位监测确定安全限值，为合理、安全施用沼液提供技术指导，建立起科学的沼液施肥体系。同时应在源头上降低重金属、抗生素等风险因素进入生态循环中，进而降低沼液在农业生产中的生态安全风险。

    第二，不同原料沼液的标准化生产与施用问题。不同原料及其组合所产生的沼液特性不同，因此沼液的施用方式和量也不相同。存在着沼液质量标准和无害化标准缺失、沼液还田量缺乏计算依据、沼液还田的政策配套不够完善等问题，需在沼液无害化还田规范制定、沼液精准还田以及沼液还田的长效运行机制等方面加大力气。从经济成本上说，浓缩沼液存在着成本高的问题，而未浓缩的沼液还不适宜于远距离运输，因此，沼液肥料化利用是存在合理的推广半径。对于相对固定的沼气工程，其服务半径也相对固定，而区域的种植作物类型及种植制度也基本稳定。因此，在相对固定的区域内，为了更好的建立沼液标准化肥料利用模式，应对沼气工程原料、发酵工艺、沼液处理与存放、沼液施用等多个方面实施标准化的管理，以有利于建立稳定的种养结合模式，推进区域沼液资源化利用效率。